Stefano Laporta è Presidente dell’Istituto Superiore per la Protezione e la Ricerca Ambientale (ISPRA) da luglio 2017, funzione per la quale presiede il Sistema Nazionale a rete per la Protezione dell’Ambiente (SNPA), che riunisce le 21 Agenzie regionali e provinciali italiane per la protezione dell’ambiente oltre ad ISPRA.
Con D.P.R. del 15/11/2016 è stato nominato Presidente, con funzioni di coordinamento organizzativo interno, della Consulta dell’ISIN (Ispettorato nazionale per la sicurezza nucleare e la radioprotezione).
Dal 7/11/2019 al 31/05/2021 ha presieduto la Consulta dei Presidenti degli Enti Pubblici di Ricerca nazionali (ConPER).
Il 23/12/2020 è stato nominato Prefetto della Repubblica.
E’ docente a contratto presso la facoltà di Scienze Politiche dell’Università “La Sapienza” di Roma.